北京堇菜，多年生草本，无地上茎，高达6-8厘米。
根状茎稍粗壮，短缩，长0.5-1厘米，粗约0.5厘米，绿色，无毛。
叶基生，莲座状；
叶片圆形或卵状心形，长2-3厘米，宽与长几相等，先端钝圆，基部心形，边缘具钝锯齿，两面无毛或沿叶脉被疏柔毛；
叶柄细长，长1.5-4.5厘米，无毛；
托叶外方者较宽，白色，膜质，约3/4与叶柄合生，内部者较窄，绿色，约1/2与叶柄合生，离生部分狭披针形，先端渐尖，边缘具稀疏的流苏状细齿。
花淡紫色，有时近白色；
花梗细弱，通常稍高出于叶丛，近中部有2枚线形小苞片；
萼片披针形或卵状披针形，长7-9毫米，宽1.5-2毫米，先端急尖，边缘狭膜质，具3脉，基部具明显伸长的附属物，附属物长2-3厘米，末端浅裂；
花瓣宽倒卵形，上瓣长约1.1厘米，宽约7毫米，侧瓣长约1.1厘米，宽约6毫米，里面近基部有明显须毛，下瓣连距长1.5-1.8厘米；
距圆筒状，稍粗壮，长6-9毫米，直伸，末端钝圆；
花药长约2毫米，药隔顶端附属物与花药近等长，下方雄蕊背部之距线形，长约5毫米；
子房无毛，花柱棍棒状，基部通常直且较细，向上渐增粗，顶部平坦，两侧及后方具明显缘边，前方具短喙，喙端具较宽的柱头孔。
蒴果无毛。
花期4-5月，果期5-7月。
