鳞茎堇菜，多年生低矮草本，具短的地上茎，高2.5-4.5厘米。
根状茎细长，垂直，具多数细根，下部具一小鳞茎；
鳞茎直径约5-6毫米，由4-6枚白色、肉质、船形的鳞片所组成，下部生多数须状根。
叶簇集茎端；
叶片长圆状卵形或近圆形，长1-2.5厘米，宽5-14毫米，先端圆或有时急尖，基部楔形或浅心形，边缘具明显的波状圆齿，无毛或下面特别是幼叶有白色柔毛；
叶柄具狭翅，通常较叶片短或近等长，被柔毛；
托叶狭，大部分与叶柄合生，分离部分极短，先端尖，无毛或疏生腺状缘毛。
花小，白色；
花梗自地上茎叶腋抽出，通常稍高于叶或与叶近等长，中部以上有2枚线形小苞片；
萼片卵形或长圆形，长3-4毫米，宽1.2-1.5毫米，先端尖，基部附属物短而圆，无毛或有缘毛；
花瓣倒卵形，侧瓣长8-10毫米，无须毛，下方花瓣长7-8毫米，有紫堇色条纹，先端有微缺；
距短而粗，呈囊状，长1.2-1.7毫米，粗约2毫米，末端钝；
花药连药隔顶部附属物长约2.5毫米，下方2枚雄蕊背部的距较短粗，末端钝而稍弯；
子房无毛，花柱基部稍膝曲，向上略增粗，柱头三角形，两侧及后方略增厚成狭的缘边，先端具明显的喙；
喙短，近直立，柱头孔与近喙等粗。
蒴果未见。
花期5-6月。
