花莛驴蹄草，多年生低矮草本，全体无毛，具多数肉质须根。
茎单一或数条，有时多达10条，直立或有时渐升，高3.5-18（-24)厘米，粗1-2毫米，通常只在顶端生1朵花，无叶或有时在中部或上部生1个叶，在叶腋不生花或有时生出1朵花，稀生2个叶。
基生叶3-10，有长柄；
叶片心状卵形或三角状卵形，有时肾形，长1-3（-3.7）厘米，宽1.2-2.8（-4）厘米，顶端圆形，基部深心形，边缘全缘或带波形，有时疏生小牙齿，叶柄长2.5-10（-15）厘米，基部具膜质长鞘。
茎生叶如存在时极小，具短柄或有时无柄，叶片长在1.2厘米以下。
花单独生于茎顶部，或2朵形成简单的单歧聚伞花序；
萼片5（-7），黄色，倒卵形，椭圆形或卵形，长0.9-1.5（-1.9）厘米，宽0.7-1.4厘米，顶端圆形；
雄蕊长3.5-7（-10）毫米，花药长圆形，花丝狭线形；
心皮（5-）6-8（-11），与雄蕊近等长，具短柄和短花柱。
蓇葖长1-1.6厘米，宽2.5-3毫米，具明显的横脉，心皮柄长1.8-3毫米，喙长约1毫米；
种子黑色，肾状椭圆球形，稍扁，长1.2-1.5毫米，光滑，有少数纵肋。
6-9月开花，7月开始结果。
