南丹参，多年生草本；
根肥厚，外表红赤色，切面淡黄色。
茎粗大，高约1米，钝四棱形，具四槽，被下向长柔毛。
叶为羽状复叶，长10-20厘米，有小叶（5)7片，顶生小叶卵圆状披针形，长4-7.5厘米，宽2-4.5厘米，先端渐尖或尾状渐尖，基部圆形或浅心形或稍偏斜，边缘具圆齿状锯齿或锯齿，草质，两面除脉上略被小疏柔毛外余部均无毛，侧脉5-6对，与中脉在上面平坦下面明显，上面绿色，下面淡绿色，侧生小叶较小，基部偏斜；
叶柄长4-6厘米，腹凹背凸，被长柔毛。
轮伞花序8至多花，组成长14-30厘米顶生总状花序或总状圆锥花序；
苞片披针形，长3-4毫米，宽约1毫米，先端锐尖，基部楔形，两面略被短柔毛，边缘全缘，具缘毛；
花梗长约4毫米，与花序轴密被长柔毛及具腺长柔毛。
花萼筒形，长8-10毫米，外面被具腺疏柔毛及短柔毛，内面在喉部被白色长刚毛，二唇形，裂至花萼长1/4，上唇宽三角形，长约2毫米，宽约5毫米，先端有靠合的3小齿，下唇较小，三角形，长1.5毫米，宽约4毫米，浅裂成2齿，齿三角形，靠近，先端锐尖。
花冠淡紫、紫至蓝紫色，长1.9-2.4厘米，外被微柔毛，内面靠近冠筒基部斜生毛环，冠筒长约10毫米，伸出花萼，基部宽约2.5毫米，向上渐宽，至喉部宽达7毫米，冠檐二唇形，上唇略作镰刀形，两侧折合，长8-12毫米，宽约5毫米，先端深凹，下唇稍短，呈长方形，长约11毫米，宽约12毫米，3裂，中裂片最大，倒心形，先端微缺，基部略收缩，长3毫米，宽6毫米，侧裂片卵圆形，较小，宽达2毫米。
能育雄蕊2，伸至上唇片，花丝长约4毫米，扁平，无毛，药隔长约19毫米，上臂长达15毫米，下臂长约4毫米，二下臂药室不发育，顶端联合。
花柱伸出，长达2.8厘米，先端不相等2浅裂，后裂片较短。
花盘前方微膨大。
小坚果椭圆形，长约3毫米，褐色，顶端有毛。
花期3-7月。
