韧黄芩，多年生草本；
根茎匍匐，具密集的纤维状须根。
茎高约3.6厘米，直立，四棱形，基部粗约1.5毫米，具细条纹，被向下曲的短柔毛但在棱角上较密集，上部具分枝或有时不分枝。
叶膜质至草质，三角形或三角状卵圆形，长1.5-3厘米，宽1.1-2.4厘米，先端急尖，基部截状楔形，边缘有缺刻状牙齿或浅牙齿，上面沿中脉及边缘被短柔毛余无毛，下面散布短柔毛，两面均具腺点，侧脉3对，与中脉两面稍突出；
叶柄长0.5-1.8厘米，腹面具沟，密被向下曲的短柔毛。
花对生，在茎及花枝顶上排列成长5-9厘米的总状花序；
花梗长2-3毫米，与序轴密被具腺微柔毛及短柔毛；
苞片卵圆形、菱形或匙形，长3-4毫米，两面疏被短柔毛，边缘具小纤毛。
花萼开花时长约2毫米，被具腺微柔毛及短柔毛，果时长达4毫米，盾片开花时高1毫米，果时高2毫米。
花冠蓝色，长1.2-1.3厘米，外面疏被微柔毛，内面无毛；
冠筒之字形，短而粗壮，长约5-6毫米，前方近基部膝曲状，喉部宽约4毫米；
冠檐2唇形，上唇盔状，长圆形，顶端微缺，下唇中裂片宽大，长圆状宽卵圆形，宽达7毫米，顶端微缺，基部略收缩，两侧裂片三角形，宽约3毫米。
雄蕊4，二强；
花丝扁平，中部以下被小纤毛。
花盘肥厚，前方隆起；
子房柄短。
花柱细长。
子房无毛，光滑。
小坚果卵圆形，深栗色，长约1毫米，径约0.7毫米，具瘤，腹面近基部具一果脐。
花期8月，果期8月以后。
