两广黄芩，多年生草本。
茎直立，四棱形，棱角上具狭翅，被微柔毛，纤细，干时带红色，具发达的腋出分枝，因而全株呈塔形，茎上节间长约为叶长之半。
叶具柄，柄长4-7毫米，腹凹背凸，具狭翅，被微柔毛；
叶片草质，线状披针形，茎生者最大，枝生者较小，长1.2-3.6厘米，宽3.5-9毫米，先端钝，基部楔状下延，边缘在中部以上每侧疏生1-2个不明显的波状圆齿，上面橄榄绿色，散布贴生微柔毛，下面色较淡，除中脉及侧脉疏被微柔毛外余皆无毛，侧脉2-3对，上面平下面多少明显。
花于茎及分枝上部着生，排列成长1.5-5厘米的总状花序；
花梗长2.5-3毫米，与序轴密被微柔毛，在中部有一对长不及0.5毫米的线形具缘毛小苞片；
苞片线状披针形至线形，具柄，全缘，长度超出花萼。
花萼花时长约2毫米，被微柔毛，盾片高0.75毫米。
花冠紫色，长达1.3厘米，外面被微柔毛，内面无毛；
冠筒基部浅囊状膨大，宽约1毫米，向上渐增大，至喉部宽达3毫米；
冠檐2唇形，上唇盔状，内凹，先端微缺，下唇中裂片近圆形，宽3毫米，先端微缺，两侧裂片卵圆形，宽2毫米。
雄蕊4，前对较长，微露出，具能育半药，退化半药不明显，后对较短，具全药，药室具髯毛；
花丝扁平，前对内侧后对两侧被小疏柔毛。
花柱细长，先端锐尖，微裂。
花盘前方微隆起，后方延伸成极短的子房柄。
子房4裂，后对裂片较大。
花期8-10月，果期11月。
