永泰黄芩，多年生草本；
根茎短；
略肥大，密生纤细的须根，向上生出1-2茎。
茎高11-25（36）厘米，基部粗1-1.2（2）毫米，钝四棱形，疏被上曲短柔毛，但上部较密集，不分枝或具少数短分枝。
叶膜质卵圆形或菱状卵圆形，长1.1-3（5.5）厘米，宽0.7-1.7（3.5）厘米，先端锐尖至钝，基部楔形至近圆形，边缘在离基部1/3以上具钝牙齿或粗圆齿，上面被稀疏的糙伏毛或近无毛下面沿各脉上疏被上曲短柔毛余无毛但散布橙色腺点，侧脉约3对，与中脉上面微突出下面十分突出；
叶柄长0.5-2厘米，疏被上曲短柔毛，背腹扁平，具极狭的翅。
花对生，在茎及分枝顶上排列成长2-4厘米的总状花序；
花梗长2-2.5毫米，与序轴被上曲短柔毛；
苞片狭椭圆形，长2-3毫米，全缘，无柄，边缘具小纤毛。
花萼开花时长约2毫米，外被短柔毛，盾片高1毫米。
花冠白色至淡紫，长2.1厘米，外面疏被微柔毛，内面无毛；
冠筒长1.8厘米，基部膝曲，中部以上渐增大，至喉部宽达5毫米；
冠檐2唇形，上唇盔状，内凹，先端微缺，宽2毫米，下唇中裂片三角形，基部收缩，先端微缺，宽5毫米，两侧裂片三角形，先端钝，宽约1.5毫米。
雄蕊4，二强；
花丝扁平，中部被纤毛。
花盘肥厚，前方膨大；
子房柄长0.5毫米。
花柱细长。
子房无毛，光滑。
成熟小坚果未见。
花期4-5月；
果期8月。
