长冠鼠尾草，一年生或二年生草本；
根茎匍匐或斜上升，短，近木质，根常增大成块根状，梭形，长1.5-3（5）厘米，粗3-5毫米，外皮朱红色，侧根丝状，多数。
茎直立或从基部上升，单生或少数丛生，钝四稜形，具槽，密被短柔毛，其间有开展的疏柔毛，或仅被开展疏柔毛。
叶基出及茎生，为三出叶至5-7小叶的奇数羽状复叶或二回羽状复叶，小叶卵形、近圆形至披针形，长0.5-5厘米，宽与长相等或较狭，先端急尖至渐尖，或钝至近圆形，基部偏斜，宽楔形或圆形，边缘具圆齿或圆齿状牙齿，草质，常下面带紫色，两面无毛或上面略被下面沿脉上被疏柔毛，下面具腺点，叶柄比叶片长或稍短，腹凹背凸，基部略宽大；
被开展长柔毛或变无毛。
轮伞花序（2）5-7花，疏离，组成伸长的顶生总状或总状圆锥花序；
苞片小，披针形，与花梗等长或短于花梗，先端渐尖，基部楔形，全缘，具长纤毛；
花梗长1-2毫米，与花序轴密被具腺疏柔毛。
花萼钟状筒形或筒形，开花时长5-8毫米，外面在脉上被具腺短柔毛，疏生浅黄色腺点，内面无硬毛环，在上半部被微硬伏毛，二唇形，唇裂约至花萼长1/4,上唇半圆形，长约1.5毫米，宽约2.5毫米，全缘，先端具3靠合小齿，下唇与上唇近等长，宽达3毫米，深2裂，齿三角形，先端渐尖，果时花萼增大，长7-11毫米，外面变无毛。
花冠红、淡紫、紫红、紫至紫蓝色，稀为白色，长1.1-2.0厘米，外面被短疏柔毛，内面近无毛，冠筒管状，长约为花萼2-3倍，在上部稍增大，冠檐二唇形，上唇直伸，长约3毫米，宽 1.75毫米，先端微缺，下唇宽大，稍长于上唇，3裂，中裂片最大，倒心形，先端微缺，边缘浅波状，侧裂片近半圆形，较小。
能育雄蕊2，稍外伸，花丝长2-3毫米，药隔近伸直，长3-4毫米，上臂稍长，下臂顶端稍膨大，且彼此联合。
花柱外伸，先端不相等2裂，后裂片较短。
花盘前方略膨大。
小坚果长圆形，长约2.5毫米，腹面具稜，顶端圆，淡褐色，稜棕褐色。
花期5-8月。
