丛茎滇紫草，一年生或二年生草本，稀为多年生，高15-25厘米，植株绿色，被稠密的伏毛及散生的硬毛。
茎单一或数条丛生，直立或斜升，由基部分枝，分枝极密，细弱或强壮。
叶披针形或倒披针形，长1-3厘米，宽3-6毫米，先端钝或圆，基部楔形，上面被向上贴伏的硬毛及伏毛，下面密生伏毛，中脉及叶缘生硬毛，无柄。
花序多数，生茎顶及枝顶，花多数，密集，花后延伸呈总状，长4-6厘米；
苞片卵状披针形，长3-7毫米；
花梗极短，长1-3毫米，密生开展的硬毛；
花萼长5-8毫米，裂至近基部，裂片披针形；
花冠蓝色，筒状钟形，长8-12毫米，喉部直径4-9毫米，裂片宽三角形，下弯，边缘反卷，外面裂片中肋被1列短伏毛，其余部分有不明显的短柔毛，内面除腺体外无毛；
花药侧面结合，长5-6毫米，大部或全部伸出花冠外，花丝长6.5-7毫米，下延部分线形，被粉质柔毛，着生花冠筒基部以上3.5-4毫米处；
腺体高不及0.5毫米，被不明显的短柔毛。
小坚果淡黄褐色，长2-2.5毫米，具光泽，有稀疏的瘤状突起及不明显的皱纹。
花果期8-9月。
