短柱灯芯草，多年生草本，高（3-）5-10（-18）厘米。
茎直立，圆柱形，纤细。
叶全部基生，最下部是低出叶，鞘状，淡红褐色，无光亮，边缘膜质，顶端常具短尖头；
基生叶线形；
叶片稍扁平，长3-11厘米，宽0.2-1.2毫米，较细的叶近圆柱形而二侧稍压扁，顶端尖；
叶鞘松弛抱茎，有叶耳。
头状花序单一顶生，呈半球形，直径1.1-1.7厘米，有（3-）7-15（-20）朵花；
苞片数枚，卵形至卵状披针形，最下面1片通常叶状，绿色，线形，斜伸，远比花序为长，其余较花短，膜质，淡白色至栗褐色或最下面第二片稍长于花；
花具短梗；
花被片卵状披针形，近等长，长4-5.5毫米，宽1-1.3毫米，顶端钝，膜质，禾秆色，具3脉；
雄蕊6枚，长于花被片；
花药线形，长1.2-1.4毫米，淡白色；
花丝与花被片近等长或稍短，淡白色至暗棕色；
子房卵形至椭圆形；
花柱线形，长约4毫米；
柱头极短，头状或几为圆球形，直径0.4毫米。
蒴果三棱状长圆形，棕色，顶端钝，长约3-3.5毫米，1室。
种子近三角状卵形，长0.6-0.7毫米，黄褐色，表面有纵条纹，两端有附属物，连同种子共长1.2-1.5毫米，种子一侧有狭的翅状附属物。
花期6-7月，果期8月。
