长耳灯芯草，多年生草本，高6-11厘米；
根状茎短，有多数淡褐黄色须根。
茎丛生，直立或斜上，圆柱形，直径0.8-1毫米，具纵沟纹。
叶基生和茎生，比花序短，基生叶1-数枚；
叶片线形，长7-24毫米，顶端尖；
叶鞘长7-23毫米，边缘膜质；
茎生叶通常2枚；
叶片圆柱形，长1.6-5厘米，直径0.5-0.7毫米，顶端尖，具完全横隔和纵条纹；
叶鞘长1-2.5厘米，边缘膜质；
叶耳明显突出，长1.4-1.7毫米，顶端渐尖或稍钝。
花序由3-7个头状花序组成，排列成聚伞状；
花序梗长短不等；
头状花序较小，直径4-7毫米，有3-5（-7）朵花；
叶状总苞片常1枚，线形，比花序短；
苞片宽卵形至长卵形，长2.5-3毫米，宽0.9-1.3毫米，顶端锐尖，膜质，背部中央有1脉；
花具短梗；
花被片披针形，近等长，长约3毫米，宽约1毫米，顶端尖锐，背面有3条纵脉，边缘膜质；
雄蕊3枚；
花药狭长圆形，长约0.9毫米，淡黄色；
花丝丝状，长约1.5毫米；
子房三棱状长圆形，长约2毫米，1室，侧膜胎座，具多数胚珠；
花柱长约1毫米；
柱头3分叉，长约1.2毫米，常弯曲。
蒴果三棱状长卵形，长3-3.5毫米（包括宿存花柱），上部渐狭至顶端有短尖头，黄褐色。
种子长圆形，长约0.6毫米，有小尖头，蜡黄色，具纵条纹。
花期5-6，果期7-8月。