高原香薷，细小草本，高3-20厘米。
茎自基部分枝，小枝尤其是在下部的依伏或上升，被短柔毛。
叶卵形，长4-24毫米，宽3-14毫米，先端钝，基部圆形或阔楔形，边缘具圆齿，上面绿色，下面较淡，或下面常带紫色，上面密被短柔毛，下面被短柔毛，但沿脉上较长而密，腺点稀疏或不明显，侧脉约5对，与中脉在上面略凹陷下面显著；
叶柄长2-8毫米，扁平，被短柔毛。
穗状花序长1-1.5厘米，生于茎、枝顶端，偏于一侧，由多花轮伞花序组成；
苞片圆形，长宽约3毫米，先端具芒尖，外面被柔毛，在脉上尤为明显；
边缘具缘毛，内面无毛，脉紫色；
花梗短，与序轴被白色柔毛。
花萼管状，长约2毫米，外面被白色柔毛，萼齿5，披针状钻形，具缘毛，长短不相等，通常前2枚较长，先端刺芒状。
花冠红紫色，长约8毫米，外被柔毛及稀疏的腺点，冠筒自基部向上扩展，冠檐二唇形，上唇直立，先端微缺，被长缘毛，全缘，下唇较开展，3裂，中裂片圆形，全缘，侧裂片弧形。
雄蕊4，前对较长，均伸出，花丝无毛。
花柱纤细，伸出，先端相等2浅裂。
小坚果长圆形，长约1毫米，深棕色。
花、果期9-11月。
