小叶唇柱苣苔，多年生小草本。
根状茎长5厘米以上，粗约1厘米。
叶均基生；
叶片干时革质，宽椭圆形，两侧稍不等，长1.7-3厘米，宽1.3-1.9厘米，两端圆形，边缘全缘，两面密被淡褐色贴伏短柔毛（毛长0.2-0.8毫米），脉不明显；
叶柄长1-1.4厘米，扁，宽约1.2毫米，有极密短柔毛。
花序2条，每花序具1花；
花序梗长5.3-5.6厘米，密被短伏毛；
苞片对生，倒卵形或椭圆形，长8-11毫米，宽约4毫米，边缘全缘，上面无毛，下面被贴伏短柔毛；
花梗长约8毫米，密被开展的腺毛。
花萼长5-6毫米，5裂达基部；
裂片线状披针形或披针形，宽0.8-2.2毫米，外面被短柔毛。
花冠紫红色，长约2.7厘米，外面下部疏被短柔毛；
筒细漏斗状，长约1.7厘米，口部粗1.1厘米；
上唇长约6毫米，下唇长9毫米。
雄蕊的花丝着生于距花冠基部7毫米处，长约11毫米，下部宽1.2毫米，被柔毛，上部宽0.6毫米，有稀疏短腺毛，在基部之上突膝状弯曲，花药长约2毫米，无毛；
退化雄蕊2，钩状，长约5毫米，顶端头状。
花盘环状，高约1毫米，边缘有浅齿。
雌蕊长约2.4厘米，子房长约1.5厘米，宽约1.1毫米，密被白色短柔毛，花柱被疏柔毛，柱头长约1.5毫米,2浅裂。
花期10月。