祁连山黄芪,多年生草本,高20-30厘米。
茎多少短缩,具条棱,被极稀疏的白色或黑色柔毛。
羽状复叶有9-13片小叶,长4-7厘米;
叶柄长2-3厘米;
托叶离生,叶状,椭圆形,长5-13毫米,宽3-7毫米,具白色缘毛;
小叶卵圆形或长圆形,长1-2厘米,宽5-10毫米,先端钝或微凹,基部宽楔形或近圆形,两面无毛或仅具缘毛。
总状花序有10余朵花,稍紧密、长1-2厘米,花序轴花后伸长;
总花梗比叶长2-3倍;
苞片线形,长4-6毫米,下面散生白色长柔毛;
花梗长约2毫米,同花序轴密被黑色柔毛;
花萼钟状,长约5毫米,萼筒带黑紫色,无毛,萼齿披针形,长约2毫米,内面被黑色柔毛;
花冠黄色,干时呈黑褐色,旗瓣宽倒卵形,长10-11毫米,先端微凹,最宽处约8毫米,基部渐狭成瓣柄,翼瓣与旗瓣近等长,瓣片长圆形,长约4毫米,基部具短耳,瓣柄细,长约为瓣片的2倍,龙骨瓣与翼瓣近等长,瓣片半卵形,瓣柄较瓣片长近2倍;
子房狭卵形,密被白色和黑色柔毛,具柄。
荚果纺锤形,长约2厘米,散生黑色柔毛,果颈与萼筒近等长,1室,有种子7-8颗;
种子肾形,暗褐色,长约2毫米。
花期7月,果期8月。