湄公鼠尾草，年生草本；
根茎粗短，其上被有棕褐色残存的叶柄；
根粗大，长可达30厘米，粗达1厘米，扭曲状，纵裂，其上有多数纤细的须根。
茎1-5，自根茎上升或直立，四稜形，被疏柔毛或渐变无毛，具少数叶对。
叶片卵圆形或长圆状卵圆形，稀有近圆形或椭圆形，长3-9厘米，宽2-8厘米，先端钝或圆形或锐尖，基部心形或浅戟形，边缘具圆齿或圆齿状锯齿，稀有重圆齿，草质，上面被或密或疏的紧贴长柔毛或短柔毛，下面在脉上被开展的疏柔毛或幼时密被长柔毛，余部具腺点，叶脉大多数近掌状开展；
基出叶叶柄最长，长约为叶片2-3倍，茎生叶叶柄向上渐变短至近无柄，被疏柔毛或变无毛。
轮伞花序具2花，下部者疏离上部者密集组成长6-10厘米顶生总状花序，有时总状花序下部多少分枝而组成总状圆锥花序；
最下部苞片叶状，具齿，上部苞片卵圆形或宽卵圆形，先端锐尖，具小尖头，基部楔状渐狭，两面被长柔毛及腺点，边缘具缘毛；
花梗长约4毫米，与花序轴密被长柔毛及混生腺毛。
花萼钟形，长1-1.5厘米，外面在脉上被具腺长柔毛，余部被小腺点，内面满布微硬伏毛，二唇形，唇裂至萼长1/2以上，上唇三角状卵圆形，全缘，先端具3个小尖头，下唇半裂成二齿，齿长三角形，先端渐尖。
花冠黄色，长3.5-4厘米，外面在冠筒背部及上唇被具腺疏柔毛，内面离冠筒基部5-6毫米有斜向不完全疏柔毛毛环，冠筒长约为花萼3倍，下部筒状，在花冠外突然背部膨大，直伸或向上弯，至喉部宽达1.1厘米，冠檐二唇形，上唇直伸或稍外弯，长宽约6毫米，先端微缺，下唇比上唇稍长，3裂，中裂片最大，倒心形，宽约8毫米，先端微缺，边缘波状，侧裂片斜卵圆形，宽4毫米，边缘具小缘毛。
能育雄蕊2，伸至上唇，花丝长约5毫米，扁平，药隔长约6毫米，弯成弧形，上下臂等长，二下臂横生药室，药室较小，先端联合。
花柱伸出，先端不相等2浅裂，后裂片较短。
花盘前方稍膨大。
成熟小坚果未见。
