短果茴芹，多年生草本，高70-85厘米。
须根。
茎圆管状，有条纹，上部2-3个分枝，无毛。
基生叶及茎中、下部叶有柄，长4-10厘米；
叶鞘长圆形；
叶片三出分裂，成三小叶，稀2回三出分裂，裂片有短柄，长0.5-1厘米，两侧的裂片卵形，长3-8厘米，宽4-6.5厘米，偶2裂，顶端的裂片宽卵形，长5-8厘米，宽4-6厘米，基部楔形，顶端短尖，边缘有钝齿或锯齿，叶脉上有毛；
茎上部叶无柄，叶片3裂，裂片披针形。
通常无总苞片，稀1-3，线形；
伞辐7-15，长2-4厘米；
小总苞片2-5，线形，短于花柄；
小伞形花序有花15-20；
萼齿较大，披针形；
花瓣阔倒卵形或近圆形，白色，基部楔形，顶端微凹，有内折的小舌片，中脉和侧脉都比较明显；
花柱基圆锥形；
花柱长为花柱基的2-3倍，向两侧弯曲。
果实卵球形，无毛，果棱线形；
每棱槽内油管2-3，合生面油管6；
胚乳腹面平直。
花果期6-9月。
