短柱茴芹，多年生草本，高30-80厘米。
根长圆锥形，长4-8厘米，有或无侧根。
茎直立，圆管状，有细条纹，微被柔毛，2-4个分枝。
基生叶和茎下部叶有柄，长4-15厘米，叶鞘长圆形；
叶片2回三出分裂，或三出式2回羽状分裂，末回裂片卵形、宽卵形，长2-5厘米，宽1.5-3厘米，基部楔形或截形，顶端渐尖或长尖，表面绿色，背面灰白色，被疏柔毛，边缘有据齿或钝齿；
茎中、上部叶较小，有短柄或无柄，2回三出分裂或羽状分裂，裂片长卵形、披针形或线形。
花序梗细柔；
通常无总苞，或偶有1片，线状披针形；
伞辐4-6 (-8)，纤细，极不等长，最长1.5-2.5厘米，有时近于无；
小总苞片2-4，线形，等于或短于花柄；
小伞形花序有花5-10；
无萼齿；
花瓣较小，宽卵形，白色，基部楔形，顶端凹陷，有内折小舌片；
花柱基短圆锥形；
花柱与花柱基近等长。
果柄不等长，长约2-3毫米；
果实卵形，较小，长约1毫米，果棱线形，无毛；
每棱槽内油管3-4，合生面油管4-6；
胚乳腹面平直。
花果期6-8月。
