察隅紫堇，直立草本，高40-50厘米。
根未见。
茎粗壮，具棱，上部具分枝，下部裸露，基部渐狭。
基生叶具柄，柄长约20厘米，上部粗壮，基部渐狭，叶片轮廓卵形，长约8厘米，三回羽状全裂，第一回裂片3对，对生，具柄，第二回裂片2对，近对生，具短柄，第三回裂片近无柄，不规则的深裂或浅裂，末回裂片狭椭圆形或狭倒卵形，先端钝，表面绿色，背面灰绿色，密被近透明的乳突；
茎生叶3-4枚，生于茎上部，具短柄或近无柄，其他与基生叶相同，但较小。
总状花序生于茎和分枝顶端，长约8厘米，有约20花，侧生花序较少花，先密后疏；
苞片羽状分裂，稀最上部者近全缘；
花梗稍粗壮，短于苞片。
萼片小，上部撕裂状；
花瓣淡蓝色．上花瓣长1.8-2.2厘米，花瓣片舟状卵形，边缘具1半圆形的突起，背部鸡冠状突起高约1毫米，微缺刻，距圆筒形，长为花瓣片的2倍，略渐狭，末端圆，下花瓣舟状长圆形，长0.8-0.9厘米，边缘除先端外具缺刻状齿，鸡冠状突起同上瓣，中部稍缢缩，基部略呈囊状，内花瓣长0.7-0.8厘米，花瓣片长圆形，具1侧生囊，鸡冠状突起高，爪近线形，长为花瓣片的一半；
雄蕊束长5-6毫米，花药小，花丝狭披针形，蜜腺体贯穿距的2/5；
子房狭椭圆形，长约0.3厘米，胚珠少数，花柱细，与子房近等长，柱头双卵形。
蒴果倒卵状长圆形，长约1厘米，粗3-4毫米，具6-8枚种子，排成2列。
种子近圆形，黑色，具光泽。
花果期6-8月。
