黄绿紫堇，直立草本，高约40厘米。
根未见。
茎1-3条，圆柱形，具纵棱，上部具分枝，下部裸露，基部线形。
基生叶柄细弱，长约15厘米，近基部渐狭，叶片三回三出分裂，第一回全裂片具长3-4厘米的柄，第二回具长约0.3-0.5厘米的柄，第三回无柄，全缘或中裂片2-3深裂，末回裂片狭椭圆形或披针形，先端急尖，表面深绿色，背面灰绿色，密被近透明的乳突；
茎生叶3-4枚，互生于茎上部，下部叶具柄，最上部叶无柄，其他与基生叶相同。
总状花序数枚，生于茎及分枝先端，长2-8厘米，密集多花；
苞片最下部者同上部茎生叶，下部者扇状羽状分裂，上部者羽状分裂，裂片线形，最上部者披针形全缘；
花梗纤细，略短于苞片。
萼片小，白色，边缘撕裂状；
花瓣黄色带绿，上花瓣长约1.7厘米，花瓣片舟状卵形，边缘具1半圆形的突起，背部鸡冠状突起高约1.5毫米且边缘呈不规则的浅波状，距圆筒形，向末端略渐狭，约占上花瓣长的3/5，下花瓣舟状长圆形，长约0.8厘米，鸡冠状突起较上瓣矮，基部通常具1下垂小距，内花瓣长约0.7厘米，花瓣片倒卵形，具1侧生囊，爪狭楔形，短于花瓣片；
雄蕊束长约0.6厘米，花药极小，花丝披针形，蜜腺体贯穿距的1/2；
子房椭圆形，长2-3毫米，具2-3枚胚珠，花柱细，先端弯曲，稍长于子房，柱头双卵形，上端具2个乳突。
蒴果（未成熟）狭椭圆形或狭倒卵状椭圆形，长约5毫米，粗约2毫米，有2-3枚种子，排成1列。
花果期8月前后。
