长距元胡，多年生草本，高10-35厘米，上升或近直立。
块茎圆球形或长圆形，直径 (1.5-)3-4厘米，质淡灰色。
茎基部以上具1鳞片，不分枝或鳞片腋内具1小枝，常具2叶。
叶苍白色，较厚，叶柄短，约等于叶片长的1/3，叶片二回三出，具全缘或深裂小叶，裂片卵圆形至披针形，常急尖。
总状花序明显高出叶，具5-25花（栽培条件下常多达30花），先密集，后疏离。
苞片卵圆状披针形至线状披针形，全缘，约与花梗等长。
花梗纤细，长5-15毫米，果期长达10-20毫米。
萼片小。
花红紫色，狭而长。
外花瓣狭，渐尖，具色暗的纵脉而龙骨状突起部位尤为明显。
上花瓣长3-4厘米；
距长2.1-2.8厘米，渐狭，直或末端常弯曲；
蜜腺体长约5毫米，钝。
下花瓣直，无囊。
内花瓣1.4-1.6(-1.8）厘米，顶端暗紫色。
柱头近四方形，具6-8乳突，基部下延。
蒴果线形，长1.8-2.5厘米，宽2-3毫米，具4-8种子。
种子平滑，长约2.5毫米，稍狭，种阜带状，长而狭，基部淡棕色。
