扇叶黄堇，多年生直立坚硬草本，灰绿色，高20-60（-90）厘米。
主根粗大，不分枝或分枝。
茎常分枝，具叶。
基生叶灰绿色，多少肉质，长10-20厘米，具柄，一回羽状全裂，具3-6对疏离的侧生的和1枚顶生的羽片；
羽片扇形，倒卵形至近圆形，下部楔形，直径1-2（-3）厘米，无柄或近无柄，常三裂，裂片上部多少具齿。
茎生叶疏生，与基生叶相似，总状花序生茎和侧枝顶端，长约5-10 (-15)厘米，先密集，后疏离。
苞片短，不伸出花芽，近膜质，钻形至三角形，约等长于花梗的1/2。
花梗长2-4毫米，果期不伸长，下弯。
花黄色，先直立，后平展。
萼片卵圆形，长约2毫米，基部常具毛发状突起或撕裂状。
外花瓣顶端盔状，具短尖，边缘近膜质。
上花瓣长1.2-1.8厘米；
距约占花瓣全长的1/3；
蜜腺体短，约占距长的1/2。
柱头顶端近平截，中央多少下凹，两侧下延，具8乳突。
蒴果长圆形，下弯，长1.2-2厘米，具8-10种子和长4-5毫米的花柱，果爿上具明显的中肋。
种子黑亮，直径约2毫米。