稀花黄堇，多年生草本，高10-15厘米，具蓝白色细粉。
根圆柱形或纺锤形，通常不分枝，上部具长约10-20厘米的根茎；
根茎散生鳞片。
茎生叶二枚以上，最下的一对对生，上部的散生，渐过渡到苞片，叶腋常具侧生的枝条。
茎生叶常高出花序，具长而多少扁化的叶柄，叶片卵圆形，约长6-7厘米，宽5-6厘米，3-4回羽状全裂，末回羽片三深裂，裂片线形，约长2-3毫米，宽0.5毫米。
总状花序伞房状，具5-10花。
苞片楔形，下部的较大，约长2.5厘米，宽2厘米，2-3回掌状深裂，末回裂片线形至狭披针形。
花梗直立，约与苞片等长稍短。
花黄白色至污黄色，直立，距常埋藏于苞片中。
萼片扇形，约长2毫米，宽3毫米，边缘具齿。
外花瓣宽展，无或具浅鸡冠状突起。
上花瓣长2-2.5厘米；
距稍长至长于瓣片的一倍，末端稍下弯；
蜜腺体约占距长的2/3。
下花瓣长约1厘米，爪较宽展，约与瓣片等长，上半部多少具波状小齿。
内花瓣长约9毫米，具鸡冠状突起，爪略短于瓣片。
柱头近四方形，2叉状分裂，具8乳突。
蒴果倒卵形，约长5毫米，宽2毫米，被蓝白色细粉，成熟时自果梗顶端多少下弯。
