散黄芩，一年生草本；
根茎匍匐，生根。
茎外倾，曲折上升，柔弱，四棱形，除棱外均密集短柔毛，分枝，多叶。
叶草质，披针状长圆形至披针状卵圆形，长3-6厘米，宽1-2厘米，先端渐尖，基部近圆形，边缘具不规则近于双重的锯齿，齿尖具胼胝体，两面暗绿色，疏被具节糙伏毛，侧脉5-6对，与中脉在上面不明显在下面突出；
叶柄长1-1.5厘米，扁平，具短柔毛。
花对生，在茎及分枝顶上排列成长6-17厘米柔弱而常曲折上升的总状花序；
花梗长约3毫米，与序轴均密被具腺的短柔毛；
苞片细小，近披针状卵圆形，与花梗近等长。
花萼开花时长约2毫米，果时稍增大，长3.5毫米，盾片半圆形，花时高1.5毫米，果时明显反折，高3毫米。
花冠淡紫色，长约1.5厘米，外面初时被细短柔毛其后近于无毛；
冠筒纤细，前方基部膝曲状，中部宽1.5毫米，喉部宽4毫米；
冠檐2唇形，上唇盔状，内凹，下唇中裂片近圆形，先端微凹，基部收缩，两侧裂片卵圆形。
雄蕊4，二强；
花丝扁平，中部以下具纤毛。
花盘肥厚，前方隆起；
子房柄极短。
花柱细长。
子房光滑。
花期3-4月。
