山菠菜，多年生草本，具有匍匐茎及从下部节上生出的密集须根。
茎多数，从基部发出，上升，下部多少伏地，高20-60厘米，钝四棱形，具疏柔毛，尤以上部为甚，紫红色。
茎叶卵圆形或卵圆状长圆形，长3-4.5厘米，宽1-1.5厘米，先端钝或近急尖，基部楔形或渐狭，上面绿色，贴生微疏柔毛或近无毛，下面淡绿色，在脉上被微疏柔毛，边缘疏生波状齿或圆齿状锯齿，侧脉3-4对，上面多少凹陷，下面稍隆起，叶柄显著，长1-2厘米，腹平背凸，多少具狭翅，被疏柔毛；
花序下方的1-2对叶较狭长，近于宽披针形，叶柄短或近于无柄。
轮伞花序6花，聚集于枝顶组成长3-5厘米的穗状花序，每一轮伞花序下方均承以苞片；
苞片向上渐变小，扁圆形，宽大，长5-8毫米，宽6-15毫米，先端染红色，具长2-3毫米尾状尖头，膜质，有自基部放射状的脉，脉在边缘上闭锁，显著，外面在脉上及边缘内方具疏柔毛，边缘上有纤毛，内面无毛；
花梗短，长约2毫米，被柔毛。
花萼连齿在内长约10毫米，先端红色或紫色，筒长4毫米，陀螺状，外面被白色具节柔毛，内面无毛，萼檐二唇形，上唇扁平，宽大，近圆形，宽约6毫米，明显具网脉，外面在两侧肋上具疏柔毛，两侧边缘具纤毛，先端有3个近截形的短齿，中齿最宽大，齿间不明显，齿尖长1毫米，为刺芒状，下唇较狭，宽3.5毫米， 2深裂，裂片达唇片长之半，披针形，具脉，边缘具缘毛，先端具小刺尖。
花冠淡紫或深紫色，长18-21毫米，冠筒长约10毫米，中部以上骤然增大，外面无毛，内面近基部1/3具近水平向的鳞毛毛环，冠檐二唇形，上唇长圆形，长9毫米，宽6毫米，内凹，龙骨状，先端微缺，外面在脊上稍具微柔毛或近于无毛，下唇宽大，长约8毫米，宽约9毫米，3裂，中裂片较大，近圆形，边缘具流苏状小裂片，侧裂片长圆形，细小，下垂。
雄蕊4，前对长很多，均上升至上唇片之下，彼此分离，扁平，极无毛，花丝先端2裂，1裂片具花药，1裂片超出于花药之上，花药2室，室极叉开。
花柱丝状，伸出于雄蕊之上，先端相等2浅裂。
花盘近平顶。
子房棕褐色，无毛。
小坚果卵珠状，长1.5毫米，宽1毫米，顶端浑圆，棕色，无毛。
花期5-7月，果期8-9月。
