海神草,多年生海生沉水草本。
根茎匍匐,侧扁,棕红色,密被厚层长纤维(叶鞘残迹)。
直立茎明显短缩。
叶互生;
叶鞘长约12厘米,宽约10毫米,仅基部边缘相覆盖,呈开口鞘状,边缘内折,叶耳生于内折边缘的上部,叶舌长5-10毫米;
叶片质韧,线形,略弯,长60-90厘米,宽6-15毫米,全缘,先端钝圆或截形,基部稍狭;
叶脉11-21条,平行。
穗状花序2-7枚着生于伸长的花序梗上,最下面的小穗包藏于退化叶状苞内,穗长3-7.5厘米,每穗3-6花;
花两性,无花被;
雄蕊3枚,无花丝,花药2室,红色,长约3.5毫米,生于倒披针形、厚大药隔的基部,药隔中肋隆起;
雌蕊1枚,长4-5毫米,倒长卵形,柱头不规则浅裂,多少呈马蹄铁形。
果实斜倒卵形,长15-30毫米,平滑,稀具瘤,喙尖,微弯,无柄而托以宿存药隔所形成的苞状物;
果皮肉质,松软,绿色,干后暗棕色,于种子萌发前自基部不规则开裂成若干瓣。
种子1枚,背面较腹面宽;
种皮膜质;
胚直生。