澳古茨藻，一年生沉水草本。
植株较粗壮，质脆易断，呈深绿色至墨绿色，基部节上生有不定根；
株高20-30厘米。
茎圆柱形，光滑无齿，直径1-2.5毫米，节间长1-3厘米；
分枝多，呈二叉状。
叶质硬，上部者3叶假轮生，下部者有时2叶近对生，无柄；
叶片狭披针形至钻状，长1-2厘米，宽1-3毫米，稍向下弯曲或反卷，先端有1-2枚具黄褐色刺细胞的细齿，边缘每侧具7-14枚锯齿，齿长为叶宽的1/2至相等，齿端具1黄褐色刺细胞，少数叶背面沿脉有稀疏刺状齿，通常1-2枚生于近叶基部，齿端具1黄褐色刺细胞；
叶鞘截圆形至倒心形，抱茎，长3-5毫米，上半部边缘具数枚细锯齿。
花单性，单生于叶腋；
雄花多生于植株上半部，椭圆形，浅黄绿色，长约1毫米，直径约0.5毫米，具1佛焰苞和1花被；
雄蕊1枚，花药4室；
花粉粒长圆形或椭圆形；
雌花裸露，长椭圆形，长约3毫米，直径约1毫米；
花柱长约0.5毫米，柱头2裂。
瘦果褐绿色至褐色，长椭圆形，长3-4毫米，直径约1毫米，上部渐狭并稍有弯曲。
外种皮细胞10余列，在种子中部呈六边形，横向明显长于轴向，排列整齐呈梯状，向种子两端，细胞横向渐渐变窄，轴向相应伸长，至种子末端，细胞呈不规则多边形或四边形，但仍排列整齐。
花果期7-11月。
2n=60。