多孔茨藻，一年生沉水草本。
植株纤细，质脆，呈黄绿色，有时节间基部呈紫红色，下部匍匐，节上生有不定根，上部直立；
株高10-20厘米。
茎圆柱形，无刺，直径0.5-1毫米，节间长0.5-0.8厘米；
分枝多，呈二叉状。
叶线形，多为3叶假轮生，于枝端较密集，无柄；
叶片线形，柔弱而伸展，长2-2.5厘米，宽0.2-0.5毫米，先端有1-2枚具黄褐色刺细胞的细齿，边缘每侧具6-24枚细锯齿，齿长约为叶宽的1/10，齿端具1黄褐色刺细胞，叶背面沿脉无刺；
叶表皮细胞为纵向的长方形，叶基扩展成鞘，抱茎，褐色，长2-2.5毫米，倒心形；
叶耳内侧无齿，先端至外侧具细锯齿4-9枚，齿端为1黄褐色刺细胞。
花单性，单生于叶腋；
雄花椭圆形，浅黄绿色，长约1毫米，多生于植株上部，具1短颈瓶状佛焰苞和1花被；
雄蕊1枚，花药4室；
花粉拉圆形至椭圆形；
雌花裸露，无花被，椭圆形；
雌蕊1枚，长约2.5毫米；
花柱长1毫米，柱头2裂，不等长，宿存。
瘦果黄色，长椭圆形，长约1.5毫米，直径约0.5毫米。
种子长椭圆形；
外种皮细胞近四边形至多边形，约20列。
花果期8-9月。
2n=12。
