莲座獐牙菜，多年生草本，高5-15厘米。
根颈明显，根褐色，细弱。
茎直立或斜上升，具不明显的4棱，中部以上分枝。
叶大部分基生，呈莲座状，具长柄，叶片匙形或倒卵形，连柄长9-21毫米，宽2-4毫米，先端钝，基部楔形，渐狭成柄，上面深绿色，下面淡绿色，均带有紫色，中脉明显；
茎生叶具柄，叶片匙形或匙状椭圆形，连柄长至17毫米，宽约3毫米，上部叶和枝上叶较小，先端钝，基部渐狭成柄，下面中脉明显。
圆锥状复聚伞花序开展，多花；
花梗直立，细瘦，具稜，长至5毫米；
花5数，直径2-3毫米，花萼绿色，长为花冠的1/2，裂片线状锥形，长约2毫米，先端锐尖，具狭膜质边缘，背面脉不明显；
花冠白色，裂片披针形或卵状披针形，长3-3.5毫米，先端急尖，下部具1个腺窝，腺窝盘状，圆形，边缘具长柔毛状流苏；
花丝线形，长约2毫米，花药矩圆状卵形，长约0.5毫米；
子房披针形，长约2.5毫米，花柱细，明显，长约0.3毫米，柱头2裂。
蒴果具短柄，卵形，长约5毫米；
种子深褐色，宽矩圆形，长约0.3毫米，表面具小疣状突起。
花果期8-10月。
