阿里山獐牙菜，一年生高大草本，高达90厘米。
根粗壮，黄褐色。
茎直立，四棱形，棱上有宽1-2毫米的翅，下部直径达8毫米，上部有分枝，枝四棱形，斜伸。
基生叶在花期枯萎；
茎生叶近无柄，长圆形至披针形，长4-8厘米，宽达3厘米，先端急尖或钝，基部圆形，叶质薄，具3脉，在下面明显突起，分枝上的叶较小，披针形，先端渐尖。
圆锥状复聚伞花开展，多花；
花梗细，长5-15毫米，上半部略膨大，有窄翅；
花4数；
花萼绿色，长于花冠，裂片披针形，长5-10毫米，先端渐尖，背面具3脉；
花冠白色？，裂片披针形，长6-9毫米，先端渐尖，基部具1个腺窝，腺窝圆形，上半部边缘具柔毛状流苏，基部有1个圆形鳞片盖于其上，鳞片上半部有齿，可以自由启合；
花丝下部扁平，长约3毫米，花药矩圆形，长约1毫米，子房卵形，长5-6毫米，花柱极短，柱头裂片半圆形。
蒴果卵状长圆形，长约1厘米；
种子多数，卵形，长约0.5毫米，表面具多数脊状突起。
花果期10-11月。
