紫萼獐牙菜，多年生草本，高20-25厘米，具短根茎。
茎黄绿色或带紫色，中空，近圆形，具细条棱，基部直径1.5-2毫米，被褐色枯老叶柄。
叶大部分基生，常对折，具长柄，叶片披针形或狭矩圆形，长4-10厘米，宽0.8-1.5厘米，先端钝，基部渐狭成柄，井向叶柄下延成狭翅，叶脉3-7条，在两面均细而明显，并在下面稍突起，在顶端联结，叶柄扁平，长1.5-5.5厘米；
茎生叶全部互生，无柄，半抱茎，卵状披针形或三角状披针形，长1.5-2.5厘米，宽0.6-1厘米。
简单或复聚伞花序长6-20厘米，具4至多花；
花梗黄绿色或带紫色，长1.2-3厘米；
花5数，直径1.5-2厘米；
花萼绿色，有时带紫色，与花冠近等长，裂片苞叶状，稍不整齐，卵状披针形，长11-16毫米，宽4-7毫米，先端渐尖，基部近心形；
花冠深蓝色或蓝紫色，裂片卵状披针形，长13-18毫米，宽5-6毫米，先端急尖，基部具2个腺窝，腺窝基部囊状，上缘具长2.5-3毫米的柔毛状流苏；
花丝线形，长7-8毫米，基部背面具流苏状短毛，花药淡蓝色，矩圆形，长2-2.5毫米，子房无柄，狭卵形，长8-10毫米，花柱不明显，柱头小，2裂，裂片半圆形。
种子（不成熟）膨胀，仅两端及棱上有不整齐的狭翅。
花期8月。
