小节眼子菜，多年生水生草本。
根茎发达，白色，直径1-2毫米，多分枝，节处生有稍密的须状根。
茎圆柱形，直径1.5-2毫米，通常不分枝。
浮水叶革质，长椭圆形或卵状椭圆形，长3-6厘米，宽1.5-3厘米，先端尖或钝，基部楔形或近圆形，具长柄；
叶脉多条，顶端连接；
沉水叶披针形，先端稍钝，具柄，常早落；
托叶膜质，长2-4厘米，鞘状抱茎。
穗状花序顶生，具花多轮，开花时伸出水面；
花序梗稍膨大，略粗于茎，开花时直立，花后自基部弯曲而使穗沉没水中，长4-6厘米；
花小，被片4，淡绿色；
雌蕊4枚，离生。
果实倒卵形，淡紫红色，长3-4毫米，背部3脊，中脊锐。
花果期7-9月。
