小花荠苎，一年生草本。
茎高25-100厘米，具分枝，具花的侧枝短，四稜形，具槽，被稀疏的具节长柔毛及混生的微柔毛。
叶卵形或卵状披针形，长2-5厘米，宽1-2.5厘米，先端急尖，基部圆形至阔楔形，边缘具细锯齿，近基部全缘，纸质，上面榄绿色，被具节疏柔毛，下面较淡，除被具节疏柔毛外满布凹陷小腺点；
叶柄纤细，长1-2厘米，腹凹背凸，被具节疏柔毛。
总状花序小，顶生于主茎及侧枝上，长2.5-4.5厘米，果时长达8厘米；
苞片极小，卵状披针形，与花梗近等长或略超出花梗，被疏柔毛；
花梗细而短，长约1毫米，与序轴被具节小疏柔毛。
花萼长约1.2毫米，宽约1.2毫米，外面被疏柔毛，略二唇形，上唇3齿极小，三角形，下唇2齿稍长于上唇，披针形，果时花萼增大。
花冠紫色或粉红色，长约2.5毫米，外被短柔毛，冠簷极短，上唇2圆裂，下唇较之略长，3裂，中裂片较长。
雄蕊4，后对雌蕊能育，不超过上唇，前对雄蕊退化至极小。
花柱先端2裂，微伸出花冠。
小坚果灰褐色，球形，直径1.5毫米，具疏网纹，无毛。
花期9-11月，果期10-12月。
