长穗荠苎，一年生草本，具圆柱形主根，其上有极多数水平侧根。
茎直立，高约40厘米，自基部向上多分枝，分枝纤弱，细长，长几与主茎相等，其上复再分枝，小枝均能育，几为花序所占，茎、枝均四稜形，褐红色，疏被污黄或白色蜷曲短柔毛，少叶。
叶线形，长0.7-1.5厘米，宽2.5-6毫米，先端钝或急尖，基部渐狭，边缘具疏齿，坚纸质，上面榄绿色，密被污黄色短疏柔毛，有时近无毛，具稀疏腺点，下面略淡，密被腺点及污黄色短疏柔毛或无毛；
叶柄长1-4（15）毫米，腹平背凸，被污黄色短疏柔毛。
顶生的穗状花序多数，几每一分枝及主茎的大部分为花序所占据，长1.5-10厘米，生于主茎上的较长，侧枝上的较短；
苞片卵状披针形，长4-4.5毫米，宽1.7-2毫米，先端突渐尖，比花梗长许多；
花梗花后长1-1.5毫米，密被柔毛。
花萼钟形，长约2.5毫米，宽约2毫米，外面密被灰黄色柔毛，肋上毛被较长，具近相等的5齿，后1齿较短，果时花萼增大，长达5毫米。
花冠浅红色，长约3毫米，外被微柔毛，内面在下唇中裂片下部被髯毛，冠筒短，长约2毫米，向上渐宽，冠檐二唇形，上唇直伸，先端微缺，下唇3裂，中裂片较大，具圆齿。
雄蕊4，后对能育，药室2，叉开，前对退化。
花柱先端相等2浅裂。
花盘前方呈指状膨大。
小坚果仅1枚成熟，灰色，球形，直径约1.2毫米，具深穴伏雕纹。
花末、初果期11月。
