毛萼山梗菜，多年生草本，高60-80厘米。
根状茎短，生多条肉质须根。
茎暗红色，被疏柔毛。
叶螺旋状排列，椭圆状披针形，长6-10 (12) 厘米，宽2-3.5厘米，先端长渐尖，基部渐狭，边缘波状或有不规则的圆齿，两面密生短柔毛；
下部的叶有柄，柄长2-3厘米，有狭翅，中部以上的叶具短柄或无柄。
花单生于茎上部苞片腋间，形成总状花序，花序长10-30厘米，花较少。
苞片叶状，下部的比花长数倍，顶部的有时较花短；
花梗长5-13毫米，密生柔毛；
花萼筒短矩圆状，密被柔毛，长宽近相等，4-6毫米，裂片条状披针形，长6-14毫米，宽1-1.5毫米，密生柔毛，边缘有稀疏腺齿和睫毛，果期常反折；
花冠紫红色至蓝紫色，长约2厘米，裂片中肋和边缘生睫毛，上唇裂片条形，稍上升，下唇裂片卵状披针形，外展；
花丝筒无毛或疏生短柔毛，花药管长约5毫米，背部疏生柔毛，仅下方2枚花药顶端生笔毛状髯毛。
蒴果短柱状，长7-8毫米，宽5-6毫米，底部平截，底部中央明显凹入。
种子椭圆状，稍压扁。
花果期8-10月。
