小果鹤虱，一年生或二年生直立草本。
茎高20-45厘米，中部以上多分枝，被白色糙伏毛。
基生叶莲座状，长圆形，先端钝，基部渐狭，长3-4厘米，果期枯萎；
茎生叶线形，长2-3厘米，宽2-4毫米，常沿中肋纵向对折，两面被灰色或灰白色具基盘的硬毛，叶缘具开展的缘毛。
花序短，果期伸长；
苞片小，线形；
果梗直立，长约2毫米；
花萼5深裂，裂片线形，长约3毫米，果期不增大；
花冠淡蓝色，钟状，长约5毫米，筒部比花萼稍长，檐部直径约4.5毫米，裂片卵圆形。
小坚果卵状，长2.5-3毫米，背面狭卵形，有颗粒状突起，沿中线龙骨突起上有短的锚状刺，边缘具1行锚状短刺，刺细，长0.8-1毫米，小坚果腹面具颗粒状突起，有时其下部具第2行（外行）短刺；
花柱细长，高出小坚果之上约0.8-1.5毫米。
