云南老鹳草，多年生草本，高30-60厘米。
根茎粗壮，围以残存基生托叶，具多数纤维状根。
茎直立，假二叉状分枝，被倒向短柔毛。
叶基生和茎上对生；
托叶狭披针形，长8-11毫米，宽3-4毫米，外被疏柔毛；
基生叶和茎下部叶具长柄，柄长为叶片的3-4倍，被短柔毛，上部叶柄渐短或近无柄；
叶片五角形，长和宽6-10厘米，5-7深裂近基部，裂片菱形，下部楔形，上部3深裂，小裂片不规则齿裂，齿裂片卵形或长卵形，表面被短伏毛，背面主要沿脉被糙毛。
总花梗腋生或顶生，长于叶，被短柔毛，具2花；
苞片和小苞片披针形，长达10毫米，宽达3毫米，外被短柔毛；
花梗与总花梗相似，长为花的1-2倍，花期直立或稍弯，果期下折；
萼片卵状椭圆形，长10-12毫米，宽3-4毫米，先端圆形，具长1-2毫米的尖头，边缘和背面沿脉被长糙毛；
花瓣紫红色或稀为白色，长为萼片的2倍，宽倒卵形，先端圆形，基部具短柄，柄和基部被糙毛；
雄蕊与萼片近等长，花丝棕褐色，下部扩展，中部以下被糙毛，花药黑紫色；
子房密被短柔毛，花柱分枝深褐色，长4-5毫米。
蒴果长2.5-3厘米，被短柔毛。
花期6-8月，果期8-9月。
