瓦山龙胆，多年生草本，高10-25厘米，基部被黑褐色枯老膜质叶鞘包围。
根茎长或短缩，平卧或直立，具多数略肉质的须根。
枝3-5个丛生，其中有2-3营养枝和1-2个花枝；
花枝直立，草黄色，有时带紫色，中空，近圆形，光滑。
叶大部分基生，线状披针形、披针形或狭椭圆形，长3-7厘米，宽0.7-1.5厘米，先端钝，基部渐狭，叶脉3条，在两面均明显，并在下面稍突起；
茎生叶2-3对，披针形或倒披针形，长2-3厘米，宽0.3-1.1厘米，先端渐尖或钝，基部渐狭，中脉明显，并在下面突起，叶柄长0.7-2厘米，愈向茎上部叶愈小，柄愈短。
花多数，顶生和腋生，聚成头状；
无花梗；
花萼筒形，长7.5-9毫米，萼筒膜质，不开裂，稀稍开裂，萼齿小，稍不整齐，钻形或线形，长1-1.5毫米，弯缺窄，圆形；
花冠蓝色，无深色条纹和斑点，漏斗形，长2.3-2.8厘米，裂片卵形，长3-3.5毫米，先端钝圆，全缘，褶偏斜，截形，边缘啮蚀状；
雄蕊着生于冠筒下部，整齐，花丝线状钻形，长10-12毫米，花药狭矩圆形，长3-4毫米；
子房线状披针形，长8-9毫米，两端渐狭，柄长8-9毫米，花柱粗，长1-2毫米，柱头2裂，裂片半圆形。
蒴果卵状椭圆形，长9-10毫米，先端渐尖，基部钝，柄长至15毫米；
种子黄褐色，有光泽，矩圆形，长1.2-1.5毫米，表面具海绵状网隙。
花果期7-9月。
