肾叶龙胆，一年生草本，高2-6厘米。
茎常带紫红色，密被黄绿色、有时夹杂紫红色乳突，在基部多分枝，枝铺散，斜升。
叶基部心形或圆形，突然收缩成柄，边缘厚软骨质，仅基部及叶柄边缘疏生短睫毛，其余平滑，两面光滑，中脉白色软骨质，光滑，在下面突起，叶柄背面密生黄绿色、有时夹杂有紫红色乳突，仅连合成长0.5-1毫米的筒；
基生叶大，在花期枯萎，宿存，长3-10毫米，宽1.5-6毫米，先端急尖，具小尖头；
茎生叶近直立，疏离，短于节间，中、下部者卵状三角形，长1.5-3毫米，宽1.5-3.5毫米，先端急尖至圆形，具外反的小尖头，上部者肾形或宽圆形，长1.5-4毫米，宽2-4.5毫米，先端圆形至截形，具外反的小尖头。
花数朵，单生于小枝顶端；
花梗常带紫红色，密被黄绿色、有时夹杂有紫红色乳突，长1.5-3毫米，藏于最上部一对叶中；
花萼宽筒形或倒锥状筒形，长5-12毫米，萼筒膜质常带紫红色，裂片绿色，直立稀外反，整齐，肾形或宽圆形，长1.2-1.5毫米，宽1.5-2毫米，先端圆形或截形，具外反的小尖头，基部心形或圆形，突然收缩成短爪，边缘厚软骨质，仅基部疏生短睫毛，其余平滑，两面光滑，中脉白色厚软骨质，在背面突起，并向萼筒下延成脊，弯缺狭窄，截形；
花冠上部蓝色或蓝紫色，下部黄绿色，高脚杯状，长9-21毫米，冠筒细筒形，冠檐突然膨大，喉部直径1.5-5毫米，裂片卵形，长1.5-2.5毫米，先端钝圆或钝，无小尖头，褶宽卵形，长1-1.5毫米，先端钝，边缘啮蚀形；
雄蕊着生于冠筒中上部，整齐，花丝丝状，长1.2-4毫米，花药狭矩圆形，长1-1.2毫米；
子房矩圆形或椭圆形，长3-7毫米，先端钝，基部渐狭成柄，柄粗，长1-3毫米，花柱线形，长1.5-3.5毫米，柱头2裂，裂片外反，宽线形。
蒴果外露或内藏，矩圆形或倒卵状矩圆形，长3.5-5毫米，先端钝圆，具宽翅，两侧边缘具狭翅，基部渐狭成柄，柄粗壮，长至18毫米；
种子淡褐色，矩圆形或椭圆形，长1-1.2毫米，表面具致密的细网纹。
花果期6-9月。
