新疆秦艽，多年生草本，高10-15厘米，全株光滑无毛，基部被枯存的纤维状叶鞘包裹。
须根数条，粘结成一个较粗的圆柱形的根。
枝少数丛生，斜升，下部黄绿色，上部紫红色，近圆形。
莲座丛叶狭椭圆形，长7-15厘米，宽1-3.5厘米，先端钝或急尖，基部渐狭，边缘平滑或微粗糙，叶脉3-5条，细，在两面均明显，并在下面突起，叶柄宽，长1.5-3.5厘米，包被于枯存的纤维叶鞘中；
茎生叶狭椭圆形或卵状椭圆形，长3.5-5.5厘米，宽0.7-2.5厘米，先端钝，基部钝，边缘平滑或粗糙，叶脉1-3条，细，在两面均明显，并在下面突起，无叶柄至叶柄长达1.5厘米。
花多数，无花梗，簇生枝顶呈头状；
花萼筒膜质，筒状，长7-10毫米，不开裂，裂片5个，线状披针形或三角状披针形，长5-7毫米，先端急尖，边缘平滑或微粗糙，中脉在背面明显；
花冠黄白色，宽筒形或筒状钟形，长2.5-3厘米，裂片卵状三角形，长3-4毫米，先端钝，全缘，褶整齐，三角形，长2.5-3毫米，2深裂；
雄蕊着生于冠筒中部，整齐，花丝线状钻形，长8-11毫米，花药狭矩圆形，长1.5-2.5毫米；
子房椭圆状披针形，长8-10毫米，两端渐狭，柄长4-6毫米，花柱线形，连柱头长2-2.5毫米，柱头2裂。
蒴果内藏，椭圆形，长13-15毫米，两端渐狭，柄长8-9毫米；
种子褐色，有光泽，矩圆形，长1.3-1.5毫米，表面具细网纹。
花果期8-9月。
