长梗秦艽，多年生草本，高10-30厘米，全株光滑无毛，基部被枯存的纤维状叶鞘包裹。
须根数条，向左扭结成一个粗大、圆柱形的根。
枝少数丛生，斜升或直立，紫红色，近圆形。
莲座丛叶厚草质，狭椭圆形或线状披针形，长3-16厘米，宽0.8-2.3厘米，先端渐尖或钝，基部渐狭，边缘平滑或微粗糙，有时边缘紫色，叶脉3-5条，在两面均明显，并在下面突起，叶柄膜质，长0.5-3厘米，包被于枯存的纤维状叶鞘中；
茎生叶厚草质，卵状椭圆形至披针形，长1-6厘米，宽0.6-1.5厘米，两端渐狭，边缘平滑或微粗糙，叶脉1-3条，在两面均明显，中脉在下面突起，无叶柄至叶柄长达1.5厘米，愈向茎上部叶愈小，柄愈短。
聚伞花序顶生及腋生，排列成疏松的花序，稀单花顶生；
花梗斜伸，紫红色，长达7厘米；
花萼筒草质，紫红色，长1.5-2.5厘米，一侧开裂呈佛焰苞状，裂片5个，不整齐，绿色，外反，披针形或狭椭圆形，长6-8毫米，先端钝或急尖，基部狭缩，边缘平滑或微粗糙，中脉在背面明显，弯缺极狭，截形；
花冠蓝紫色或深蓝色，漏斗形，长4-4.5厘米，裂片卵形或卵圆形，长9-11毫米，先端钝圆，全缘或边缘有不明显细齿，褶偏斜，三角形，长4-6毫米，先端急尖，边缘有不规则细齿；
雄蕊着生于冠筒中下部，整齐，花丝线状钻形，长12-15毫米，花药椭圆形，长3.5-4毫米；
子房狭椭圆形，长12-15毫米，两端渐狭，柄长4-5毫米，花柱线形，连柱头长3-4毫米，柱头2裂，裂片线状三角形。
蒴果内藏，狭椭圆形，长15-18毫米，先端钝，基部渐狭，柄长10-15毫米；
种子淡褐色，有光泽，矩圆形，长1.3-1.5毫米，表面具细网纹，一端具翅。
花果期8-10月。
