三歧龙胆，多年生草本，高15-35厘米，基部被黑褐色枯老膜质叶鞘包围。
根茎长或短缩，平卧或斜伸，具多数略肉质的须根。
枝2-7个丛生，其中有1-5营养枝茎和1-2个花枝；
花枝直立，黄绿色或紫红色，中空，近圆形，光滑。
叶大部分基生，狭椭圆形、线状披针形至倒披针形，长2-8厘米，宽0.3-1.3厘米，先端钝，基部渐狭，叶脉3条，在两面均明显，并在下面稍突起，叶柄膜质，长1.5-5厘米；
茎生叶3-5对，椭圆形、狭椭圆形至披针形，长2-4.7厘米，宽0.2-1厘米，先端钝，基部渐狭，叶脉1-3条，在两面均明显，并在下面稍突起，叶柄长至2.5厘米，愈向茎上部叶愈小，柄愈短。
花3-8朵，顶生和腋生，作三歧分枝，组成圆锥状聚伞花序；
花梗不等长，长0.5-5厘米；
花萼倒锥形，长1.5-2厘米，萼筒不开裂，裂片直立或稍开展，不整齐，叶状，披针形或狭椭圆形，长2-6毫米，先端钝，脉不明显，弯缺宽，截形；
花冠蓝色，或有时下部黄白色，具深蓝色细的、或长或短的条纹，狭漏斗形或漏斗形，长4-5厘米，裂片卵形，长3-4.5毫米，先端钝，全缘，褶偏斜，截形，边缘有不明显波状齿；
雄蕊着生于冠筒中部，花丝线状钻形，长13-15毫米，花药狭矩圆形，长3-4毫米；
子房线形或线状披针形，长1.7-2厘米，两端渐狭，柄长1.5-2厘米，花柱明显，连柱头长2-2.5毫米，柱头2裂，裂片外卷。
半圆形。
蒴果内藏或仅先端外露，狭椭圆形，长2-2.5厘米，先端渐尖，基部钝，柄长2.1-2.7厘米；
种子褐色，有光泽，矩圆形，长2-2.5毫米，表面具海绵状网隙。
花果期7-9月。
