锡金龙胆，多年生草本，高3-10厘米，具长匍匐茎。
须根少，细长。
枝直立，黄绿色或带紫红色，具细条棱，基部具黑褐色枯存残叶。
叶先端钝圆或圆形，基部渐狭，边缘具乳突或平滑，中脉在下面突起；
基生叶具柄，近圆形，长6-10毫米；
中、下部叶疏离，最上部3-4对叶密集，矩圆形至匙形，长6-16毫米，宽3.5-8毫米，叶柄膜质，扁平，长4-13毫米，宽2-4.5毫米，愈向茎上部叶愈大，柄愈宽。
花3-8朵，簇生枝端呈头状，包被于上部叶丛中；
无花梗；
花萼筒膜质，黄绿色，长7-8毫米，裂片小，绿色，不整齐。
披针形或线形，长1.5-4（5）毫米，先端急尖，边缘平滑或具细乳突，中脉在背面明显，弯缺圆形；
花冠蓝色或蓝紫色，具深蓝色条纹，筒形，长2-2.5厘米，裂片卵形，长2.8-3.2毫米，先端钝，全缘，褶偏斜，截形或宽三角形，长0.5-1毫米，先端钝，全缘或有不整齐细齿；
雄蕊着生于冠筒中部，达冠筒上部，整齐，花丝钻形，长5-8毫米，花药狭矩圆形，长1.2-1.5毫米；
子房狭椭圆形，长7-9毫米，两端钝，柄长7-9毫米，花柱短，圆柱状，连柱头长1.5-2毫米，柱头2裂，裂片外反，矩圆形。
蒴果内藏或先端外露，椭圆形，长10-12毫米，两端钝，柄细，直立，长至12毫米；
种子黄褐色，光滑，近球形或矩圆形，长0.6-1毫米。
表面具海绵状网隙。
花果期8-11月。
