小龙胆，一年生草本，高2-3厘米，茎直立，光滑，黄绿色或紫红色，不分枝或在基部有2-3个分枝。
叶坚硬，近革质，边缘软骨质，下缘有细乳突，上缘平滑或有不明显细乳突，两面光滑，叶脉1-3条，仅在背面明显；
基生叶大，近圆形或宽椭圆形，长7-22毫米，宽6-8毫米，先端钝或圆形，有短小尖头，叶柄宽，扁平，光滑，长1-2毫米；
茎生叶3-4对，对折，密集，覆瓦状排列，匙形、线状披针形至线形，长5-8毫米，宽3-5毫米，先端钝圆至渐尖，有小尖头，叶柄边缘具乳突，连合成长1-1.5毫米的筒。
花数朵，单生于小枝顶端，密集；
近无花梗，藏于上部叶中；
花萼漏斗形，长8-9毫米，裂片坚硬，近革质，线状三角形或狭三角形，长2-3毫米，先端急尖，有小尖头，边缘软骨质，狭窄，具乳突，中脉在背面呈脊状突起，弯缺截形；
花冠蓝色，宽筒形，长12-14毫米，裂片卵形，长2-3毫米，先端钝或渐尖，褶卵形，长1.5-2.5毫米，先端钝，全缘；
雄蕊着生于冠筒中部，整齐，花丝线形，长1.5-3毫米，花药矩圆形或线状矩圆形，长1.2-1.5毫米；
子房椭圆形，长3-4毫米，先端钝，基部渐狭，柄粗，长2-3毫米，花柱线形，连柱头长2-3毫米，柱头2裂，裂片线形。
蒴果仅先端外露，倒卵形或矩圆状匙形，长7-9毫米，先端圆形，具宽翅，两侧边缘具狭翅，基部渐狭，柄粗壮，长至8毫米；
种子小，极多，褐色，有光泽，椭圆形，长（1.2）1.5-1.8毫米，表面具细网纹。
花果期4-8月。
