斑点龙胆，多年生草本，高10-15厘米，基部被黑褐色的枯老膜质叶鞘包围。
茎3-7个丛生，其中有2-5个营养枝和1-2个花枝；
花枝直立，紫红色，中空，近圆形，具乳突，尤以上部为密。
叶大部分基生，狭椭圆形或倒披针形，长2-7厘米，宽0.5-2.3厘米，先端钝，基部渐狭，叶脉3-5条，在两面均明显，并在下面突起，叶柄膜质，长2-5厘米；
茎生叶2-3对，狭椭圆形、披针形或倒披针形，长1.5-2.5厘米，宽0.2-0.55厘米，先端钝，基部钝或渐狭，叶脉1-3条，在下面微突起，叶柄长至1厘米，愈向茎上部叶愈小，柄愈短，最上部叶无柄。
花多数，顶生和生上部叶腋中，聚成头状或呈轮伞状；
无花梗；
花萼筒状漏斗形，长9-11毫米，萼筒膜质，不开裂或一侧开裂，外面具乳突，裂片反折或开展，不整齐，狭披针形或线形，长2-6毫米，先端钝，边缘具乳突或短睫毛，弯缺圆形；
花冠黄色，具多数蓝色斑点及细条纹，狭漏斗形，长2.5-3厘米，裂片卵形，长3-4毫米，先端钝圆，全缘。
褶偏斜，截形或三角形，长1-1.5毫米，全缘，雄蕊着生于冠筒下部，整齐，花丝丝状钻形，长9-12毫米，花药狭椭圆形，长2.5-3.5毫米；
子房线状披针形，长6-9毫米，两端渐狭，柄长11-14毫米，花柱粗，连柱头长3.5-4毫米，柱头2裂，裂片半圆形。
蒴果内藏，椭圆状披针形，长8-12毫米，柄细，长至18毫米；
种子黄褐色，有光泽，宽矩圆形或近圆形，长1.5-1.7毫米，表面具海绵状网隙。
花果期7-11月。
