阿墩子龙胆，多年生草本，高5-20厘米，基部被黑褐色枯老膜质叶鞘包围。
枝2-5个丛生，其中有1-4个营养枝和1个花枝；
花枝直立，黄绿色或紫红色，中空，近圆形，具乳突，尤以茎上部为密。
叶大部分基生，狭椭圆形或倒披针形，长3-8厘米，宽0.4-1.3厘米，先端钝或钝圆，基部渐狭，叶脉1-3条，在两面均明显，并在下面稍突起，叶柄膜质，长2-7厘米；
茎生叶3-4对，匙形或倒披针形，长2.5-3.5厘米，宽0.5-1厘米，先端钝圆，基部钝，叶柄长至2厘米，愈向茎上部叶愈小，柄愈短至无柄。
花多数，顶生和腋生，聚成头状或在花枝上部作三歧分枝，从叶腋内抽出总花梗；
总花梗长至7厘米，无小花梗；
花萼倒锥状筒形或筒形，长8-10毫米，外面有时具乳突，萼筒膜质，不开裂或开裂，裂片反折，不整齐，披针形或线形，长2-3毫米，先端急尖，弯缺狭，截形，花冠深蓝色，有时具蓝色斑点，无条纹，漏斗形，长（2.3）3-3.5厘米，裂片卵形，长3.5-5毫米，先端钝，边缘有不明显的细齿，褶偏斜，截形或三角形，长1-1.5毫米，边缘有不整齐细齿；
雄蕊着生于冠筒中下部，整齐，花丝线形，长8-10毫米，花药狭矩圆形。
长2.5-3.5毫米；
子房线状披针形，长7-12毫米，两端渐狭，柄长9-10毫米，花柱连柱头长4-5毫米，柱头2裂，裂片卵形。
蒴果内藏，椭圆状披针形，长1.5-2厘米。
柄细，长至1厘米；
种子黄褐色，有光泽，宽矩圆形，长1.5-2毫米，表面具海绵状网隙。
花果期6-11月。
