高山龙胆，多年生草本，高8-20厘米，基部被黑褐色枯老膜质叶鞘包围。
根茎短缩，直立或斜伸，具多数略肉质的须根。
枝2-4个丛生，其中有1-3个营养枝和1个花枝；
花枝直立，黄绿色，近圆形，中空，光滑。
叶大部分基生，常对折，线状椭圆形和线状披针形，长2-5.5厘米，宽0.3-0.5厘米，先端钝，基部渐狭，叶脉1-3条，在两面均明显，并在下面稍突起，叶柄膜质，长1-3.5厘米；
茎生叶1-3对，叶片狭椭圆形或椭圆状披针形，长1.8-2.8厘米，宽0.4-0.8厘米，两端钝，叶脉1-3条，在两面均明显，并在下面稍突起，叶柄短，长至0.6厘米，愈向茎上部叶愈小，柄愈短。
花常1-3朵，稀至5朵，顶生；
无花梗或具短花梗；
花萼钟形或倒锥形，长2-2.2厘米，萼筒膜质，不开裂或一侧开裂，萼齿不整齐，线状披针形或狭矩圆形，长5-8毫米，先端钝，弯缺狭窄，截形；
花冠黄白色，具多数深蓝色斑点，尤以冠檐部为多，筒状钟形或漏斗形，长4-5厘米，裂片三角形或卵状三角形，长5-6毫米，先端钝，全缘，褶偏斜，截形，全缘或边缘有不明显细齿；
雄蕊着生于冠筒中下部，整齐，花丝线状钻形，长13-16毫米，花药狭矩圆形，长2.5-3.2毫米；
子房线状披针形，长13-15毫米，两端渐狭，柄长10-15毫米，花柱细，连柱头长4-6毫米，柱头2裂，裂片外反，线形。
蒴果内藏或外露，椭圆状披针形，长2-3厘米，先端急尖，基部钝，柄细长，长至4.5厘米；
种子黄褐色，有光泽，宽矩圆形或近圆形，长1.4-1.6毫米，表面具海绵状网隙。
染色体2n=24，26．花果期7-9月。
