黄紫堇，无毛草本，高50-90厘米。
主根长达13厘米，具少数侧根，干时褐色；
根茎极短，盖以稀疏的残枯叶基。
茎柔弱，通常多曲折，四棱状，常自下部分枝。
基生叶少数，具长柄，叶片轮廓宽卵形或三角形，三回三出分裂，第一回全裂片具较长的柄，第二回具较短柄，羽状深裂或浅裂，小裂片倒卵形、菱状倒卵形或卵形，先端圆或钝，具短尖，背面具白粉，二歧状细脉明显；
茎生叶多数，下部者具长柄，上部者具短柄，其他与基生叶相同。
总状花序生于茎和分枝先端，长3-5厘米，果时达9厘米，有4-6花，排列稀疏；
苞片宽卵形至卵形，长0.5-1厘米，全缘；
花梗劲直，纤细，远短于苞片。
萼片鳞片状，近肾形，边缘具缺刻状齿；
花瓣黄色，上花瓣长1.8-2厘米，花瓣片舟状卵形，先端渐尖，背部鸡冠状突起高1-1.5毫米，超出瓣片先端并延伸至其中部，距圆筒形，与花瓣片近等长或稍长，末端略下弯，下花瓣长1-1.2厘米，鸡冠同上瓣，中部稍缢缩，下部呈浅囊状，内花瓣长8-9毫米，花瓣片倒卵形，具1侧生囊，爪线形，略长于花瓣片；
雄蕊束长7-8毫米，花药极小，花丝披针形，蜜腺体贯穿距的2/5-1/2；
子房狭倒卵形，长4-5毫米，具2列胚珠，花柱细，比子房短，柱头扁长方形，上端具4乳突。
蒴果狭倒卵形，长1-1.4厘米，粗约3毫米，有6-10枚种子，排成2列。
种子近圆形，直径约1.5毫米，黑色，具光泽。
花果期6-9月。
