短爪黄堇，无毛草本，高30-40（-100)厘米。
主根明显，粗壮，具纤维状细根。
茎直立，自基部多分枝。
基生叶多数，叶柄长3-4厘米，基部具长和宽的鞘，叶片二回三出或通常二回五数分裂，第一回全裂片具长柄，疏离，第二回具短柄，3-5浅裂，小裂片倒卵状长圆形，先端具短尖或近圆，基部楔形，两面均具白粉；
茎生叶多数，具叶柄，叶柄基部具鞘，其他与基生叶相同。
总状花序生于茎和分枝先端，长3-4.5厘米，果时延长，有4-7花，排列稀疏；
苞片最下部者同上部茎生叶，上部者披针状菱形，最上部者匙状菱形，长0.5-1.5厘米；
花梗劲直，花后弯曲，短于苞片。
萼片鳞片状，倒披针形或倒卵形，上部具缺刻，迟落；
花瓣黄色，上花瓣长1.5-1.8厘米，花瓣片舟状卵形，先端具短尖，背部鸡冠状突起矮，距纤细，圆筒形，占上花瓣长的3/5，末端圆，略下弯，下花瓣舟状倒披针形，长7-8毫米，背部具矮鸡冠状突起，爪短，长仅占整个花瓣的1/4，内花瓣提琴形，长6-7毫米，花瓣片倒卵形，先端平截，具钝尖头，侧边具1囊，基部楔形，不对称，爪线状楔形，长仅占整个花瓣的1/4；
雄蕊束长约6毫米，花药小，花丝线状披针形，蜜腺体贯穿距的2/3;子房线状长圆形，长3-4毫米，胚珠数枚，排成2列，花柱比子房短，柱头近四方形，上端具4乳突，基部两侧下延，各具1乳突。
蒴果线状长圆形或极狭的倒卵状长圆形，长1.6-2厘米，具12-16枚种子，通常排成2列，成熟时自果梗基部反折。
种子近圆形，直径1-1.5毫米，黑色，具光泽。
花果期8月前后。
