三小叶碎米荠，多年生草本，高12-20厘米；
根状茎短，具须根。
茎直立或斜升，不分枝或稍分枝，无毛或基部有疏单毛。
叶少数，茎下部的叶长4-4.5厘米，有小叶1对，顶生小叶宽卵形，长约1O毫米，宽约13毫米，边缘上端呈微波状3钝裂，裂片顶端有小尖头，基部浅心形或近截形，小叶柄长约5毫米，侧生小叶近卵形，长、宽各约5毫米，小叶柄极短；
中部叶长3-4厘米，有小叶2对，顶生小叶倒卵形，上端3齿裂，基部楔形，侧生小叶向下渐次变小；
上部小叶长2-3厘米，单一或成对，线形，顶端渐尖，全缘或具1齿，基部狭细；
全部小叶上面散生白色单毛，下面毛较少，并具缘毛。
总状花序生于枝端，花少，疏生，花梗丝状，长约4毫米；
萼片长卵形，长约2.5毫米，边缘白色膜质，外面疏生单毛，内轮萼片基部稍呈囊状；
花瓣白色、粉红色或紫色，倒卵形，长约5毫米，顶端钝圆、截平或微凹；
花丝扁平而扩大；
子房圆柱形，被有单毛，柱头扁压状，微2裂。
未成熟长角果线形，果瓣平，有稀疏单毛。
花、果期5-6月。
