光头山碎米荠，多年生草本，高达26厘米，有1至数条线形根状匍匐茎。
茎单一，通常不分枝，有时自根状茎处丛生，直立或仅基部稍倾斜，表面有沟棱，下部有白色柔毛，上部光滑无毛。
生于匍匐茎上的叶小，单叶，肾形，长3.5-6毫米，宽6-8毫米；
边缘波状，质薄，叶柄柔弱，长2-10毫米；
基生叶亦为单叶，肾形，长6-12毫米，宽6-16毫米，边缘波状，叶柄长10-12毫米；
茎生叶无柄，3小叶，顶生小叶大，肾形、心形或卵形，长1-5.4（-9）厘米，宽1.1-3.5（-4.5）厘米，顶端钝圆，基部心形或阔楔形，通常向叶柄下延，边缘有3-7个波状圆齿，顶端有小尖头，侧生的1对小叶着生于顶生小叶的基部，形小，略呈菱状卵形，有时肾形，边缘具波状钝齿；
全部小叶无毛。
总状花序有花3-10朵，花梗细，长5-16毫米；
萼片卵形，长约2.5毫米，边缘膜质，内轮萼片基部呈囊状；
花瓣白色，倒卵状楔形，长约7毫米；
雌蕊柱状，花柱细，与子房近于等长，柱头头状，比花柱宽大。
长角果稍扁平，长15-20毫米，宽约1毫米，无毛；
果梗纤细，直立或微弯，长11-16毫米。
种子长圆形，稍扁平，长约1.8厘米，宽约0.7毫米，黄褐色，一端有窄翅。
花期4-6月，果期6-7月。
